Jorge Martín dominó la sesión de clasificación para el Gran Premio de Japón de MotoGP para asegurar la pole position en las carreras de Motegi. Estableció un nuevo récord del circuito en solo su segunda vuelta y mantuvo su liderazgo en todo momento.
Al comienzo de la sesión Q2, Marco Bezzecchi (Mooney VR46 Racing Team/Ducati) perdió el control de su moto y tuvo un accidente significativo. Afortunadamente, escapó sin lesiones importantes y rápidamente volvió a los pits para subirse a su segunda moto.
Después de las primeras vueltas rápidas, Martín (Prima Pramac/Ducati) lideraba con una ventaja de 0.411 segundos sobre Marc Márquez (Repsol Honda), con Brad Binder (Red Bull KTM) en tercer lugar. En su segunda vuelta, Martín amplió aún más su ventaja con un nuevo récord de vuelta: 1m43.198s. Jack Miller (Red Bull KTM) pasó al segundo lugar.
Con aproximadamente tres minutos restantes, Francesco Bagnaia (Ducati) aseguró un lugar en la primera fila con el tercer tiempo más rápido, pero fue rápidamente superado por Fabio Di Giannantonio (Gresini/Ducati), Márquez y Aleix Espargaró (Aprilia).
El líder del campeonato reaccionó y mejoró para tomar el segundo lugar, pero se mantuvo a 0.171 segundos del líder Martín. Martín no mejoró su tiempo pero hizo lo suficiente para asegurar la pole position. Bagnaia y Miller terminaron en segundo y tercer lugar, con Bezzecchi en cuarto después de su accidente. Binder y Di Giannantonio completaron la segunda fila por delante de Márquez.
Resultados de la Q2:
Resultados generales de la clasificación: