Riccardo Rossi est apparu comme le leader de la séance Moto3 Q1 lors du GP du Japon. En conséquence, l’Italien était l’un des quatre derniers pilotes à sécuriser une place dans la bataille pour la pole position à Motegi.
Après les premiers tours rapides, Taiyo Furusato (Honda Team Asia) était en tête devant Scott Ogden (VisionTrack Racing Team/Honda), Mario Aji (Honda Team Asia) et José Antonio Rueda (Red Bull KTM Ajo). Cependant, plusieurs pilotes n’ont publié leurs premiers temps de tour que plus tard.
Filippo Farioli (Red Bull KTM Tech3) s’est brièvement hissé à la deuxième place, écartant Rueda des positions de qualification, puis a fait une chute à haute vitesse au virage deux. Joel Kelso (CFMoto Racing PrüstelGP) a dépassé Furusato avec six minutes restantes pour devenir le nouveau leader. En même temps, son coéquipier, Xavi Artigas, est passé en troisième position.
Malgré des améliorations des temps au tour, les quatre premiers sont restés inchangés, Kelso, Furusato, Artigas et Farioli occupant ces positions.
Cependant, cela a changé dans les deux dernières minutes lorsque Rossi (SIC58 Squadra Corse/Honda) est devenu le nouveau leader et que Rueda est passé en quatrième position. En conséquence, Artigas est sorti de la zone de qualification de 0,039s. Les classements n’ont pas changé davantage jusqu’à la fin, et donc les quatre derniers participants en Q2 sont Rossi, Kelso, Furusato et Rueda.
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