Diogo Moreira ha iniziato il GP del Giappone di Moto3 come il pilota più veloce nella prima sessione di prove. È stato proprio alla fine della sessione che il pilota brasiliano ha stabilito il tempo di riferimento della mattina a Motegi.
Dopo continui cambiamenti in testa durante i primi 15 minuti, Jaume Masiá (Leopard Racing/Honda) ha mantenuto il primo posto per circa 13 minuti fino a quando è stato superato da Ryusei Yamanaka (Gaviota GasGas Aspar). Gli ultimi 15 minuti sono stati nuovamente intensi, con molta instabilità nella classifica dei tempi.
Alla fine, Moreira (MT Helmets-MSi/KTM) – che aveva brevemente preso il comando in precedenza – ha realizzato due giri veloci consecutivi che lo hanno portato in testa. Il suo miglior tempo è stato di 1m57.260s, permettendogli di battere David Muñoz (BOE Motorsports/KTM) di 0.206s. Masiá ha concluso al terzo posto. Più indietro nel gruppo, l’altro pilota in testa al campionato, Daniel Holgado (Red Bull KTM Tech3), si è piazzato sesto.
Tabella dei tempi: