リカルド・ロッシは、日本GPのMoto3 Q1セッションでリーダーとして浮上しました。その結果、イタリア人は最後の4人のライダーの1人となり、モテギでのポールポジション争いのスポットを確保しました。
最初の飛行周回後、太陽フルサト(ホンダチームアジア)がスコット・オグデン(VisionTrack Racing Team / Honda)、マリオ・アジ(ホンダチームアジア)、ホセ・アントニオ・ルエダ(レッドブルKTMアホ)の前にリーダーでした。しかし、いくつかのライダーは後で初めて自分の周回タイムを記録しました。
フィリッポ・ファリオリ(レッドブルKTMテック3)は一時的に2位に上がり、ルエダを予選ポジションから押し出し、その後ターン2でハイサイドを起こしました。ジョエル・ケルソ(CFMoto Racing PrüstelGP)は残り6分でフルサトを抜いて新たなリーダーになりました。同時に、彼のチームメイトであるシャビ・アルティガスも3位に上がりました。
ラップタイムの改善にもかかわらず、トップ4は変わらず、ケルソ、フルサト、アルティガス、ファリオリがそれらのポジションを保持していました。
しかし、最後の2分でロッシ(SIC58 Squadra Corse / Honda)が新たなリーダーになり、ルエダが4位に上がりました。その結果、アルティガスは予選ゾーンから0.039秒差で脱落しました。結果は最後まで変わらず、Q2の最後の4人の参加者はロッシ、ケルソ、フルサト、ルエダです。
結果: